本系教育目標以培育兼顧理論與實作能力之土木工程及科技人才，使其具有團隊合作及多領域整合能力、專業倫理、國際觀及終生學習精神，並強化學生之土木防災及永續工程教育。因此，大學部以培養土木工程通才為主，理論與實務並重，學以致用為目的，碩士班、碩士在職進修專班、及博士班則以培養土木工程專業人才為目標，工程與科學相互為用，培養研究生獨立思考及創造開發的能力。 國立中興大學土木工程學系自創立以來，已培育許多優秀工程人才，參與國家重大工程建設，經先後同仁歷年努力所奠定的基礎，在學術和專業領域上建立了權威性。展望未來，為配合國家教育政策，並參與帶動我國土木工程學術的水準，本系除強化既有基礎之發展外，順應世界最新學術潮流，並配合國家建設的需求，推動更高層次的科技學術發展，一方面培養土木工程人才，以因應國家建設所需，一方面從事有關科學與技術的研究發展，以提升科技應用水準，邁向國際頂尖。